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circos在windows ActivePerl下的安装

2016-12-14 作者:蔡文涛CAU

1. 安装Perl

运行circos需要Perl来编译其各种code,unix环境默认安装Perl的,而对于windows用户来说,需要自己安装,也可以通过Perl –v 确认是否已安装。可以安装 Strawberry Perl或者ActiveState Perl都可以通过CPAN shell来安装模块。(模块安装见第二步)

 

2、circos安装和运行

1)下载安装文件:在 http://www.circos.ca/software/download/circos 页面下载circos安装文件。比如Circos-0.66.tgz. 把此压缩文件解压,放到我们想安装的地方,比如C:\Circos-0.66,里面所对应的文件如下:

circos-0.66

CHANGES

README

TODO

bin/

etc/

fonts/

lib/

tiles/

tools/

 

2)下载tutorials

在http://www.circos.ca/software/download/tutorials 页面下载 circos tutorial文件,比如circos-tutorials-0.66.tgz , 将其解压,把所有文件放到C:\Cicos-0.66下。

data/

tutorials/

3、安装Perl modules:运行Perl 需要将以下modules都安装起来

Config::General (v2.50 or later)

Font::TTF

GD

List::MoreUtils

Math::Bezier

Math::Round

Math::VecStat

Params::Validate

Readonly

Regexp::Common

Set::IntSpan (v1.16 or later)

Text::Format

安装方法:CPAN

.

Config::General 

遇到yes的输入yes

等等



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